W analizowanej sytuacji kluczowe znaczenie ma charakter dokonywanych czynności. Skoro planowana sprzedaż nieruchomości nadal będzie korzystała ze zwolnienia przewidzianego w art. 43 ust. 1 pkt 10 VATU, to czynność ta nie rodzi obowiązku rejestracji na potrzeby VAT. Przepisy VATU nie nakładają obowiązku rejestracji w przypadku wykonywania wyłącznie czynności zwolnionych przedmiotowo od VAT. Obowiązek taki powstaje dopiero w sytuacji wykonywania czynności podlegających opodatkowaniu VAT lub w przypadku, gdyby podatnik chciał zrezygnować ze zwolnienia przewidzianego przez ustawodawcę w art. 43 ust. 1 pkt 10 VATU.
Zgodnie z art. 96 ust. 9a pkt 3 VATU: „Wykreśleniu z urzędu z rejestru jako podatnik VAT podlega także podatnik, który składał przez 6 kolejnych miesięcy lub 2 kolejne kwartały deklaracje, o których mowa w art. 99 ust. 1, 2 lub 3, w których nie wykazał sprzedaży, nabycia towarów lub usług ani importu towarów z kwotami podatku do odliczenia”.
Wykreślenie z rejestru podatników VAT czynnych nie oznacza utraty statusu podatnika w rozumieniu art. 15 VATU, lecz jedynie utratę formalnego statusu podatnika VAT czynnego, który wiąże się z określonymi obowiązkami ewidencyjnymi i sprawozdawczymi. Podatnik, który nadal wykonuje działalność gospodarczą, pozostaje podatnikiem VAT, jednak w sytuacji, gdy wykonuje wyłącznie czynności zwolnione od VAT, funkcjonuje poza reżimem obowiązkowej rejestracji na potrzeby VAT.
Podatnik wykreślony z rejestru podatników VAT czynnych, który dokonuje wyłącznie dostaw nieruchomości objętych zwolnieniem od VAT, nie ma obowiązku ponownej rejestracji dla potrzeb VAT wyłącznie z tego powodu. Brak jest również obowiązku składania plików JPK V7, gdyż obowiązek ten dotyczy wyłącznie podatników zarejestrowanych jako podatnicy VAT czynni. Tym samym sprzedaż zwolniona od VAT nie podlega raportowaniu w strukturze JPK w sytuacji braku rejestracji na potrzeby VAT.
