Spółka powinna w kalkulacji VAT uwzględnić odsprzedaż benefitów na rzecz współpracowników (w wysokości refakturowanej) i na rzecz pracowników (w wysokości wartości rynkowej).
Zgodnie z art. 90 ust. 3 VATU proporcję VAT ustala się jako udział rocznego obrotu z tytułu czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, w całkowitym obrocie uzyskanym z tytułu czynności, w związku z którymi podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, oraz czynności, w związku z którymi podatnikowi nie przysługuje takie prawo. Według art. 90 ust. 9a VATU do obrotu nie wlicza się kwoty podatku, więc kwoty obrotu uwzględniane w kalkulacji proporcji VAT powinny odpowiadać podstawie opodatkowania danej czynności.
W przypadku refakturowania na rzecz współpracowników, podstawą opodatkowania jest kwota od nich należna, bez uwzględniania VAT (art. 29a ust. 1 i art. 29a ust. 6 pkt 1 VATU). Ta wartość, która wynika z refakturowania kart sportowych (bez uwzględniania stawki 8% VAT), powinna trafić do kalkulacji proporcji VAT.
Natomiast w przypadku pracowników zasadne jest stosowanie podejścia, że w przypadku benefitów pracowniczych podstawą opodatkowania jest zarówno kwota finansowana przez pracodawcę, jak i przez pracownika (art. 32 ust. 1 VATU). Dlatego też ta wartość powinna trafić do kalkulacji proporcji VAT (należy tu jednak pilnować, aby do kalkulacji nie trafił dwukrotnie obrót z tego tytułu).
Organy podatkowe wskazują, że obrót z tytułu benefitów pracowniczych nie jest uwzględniany w kalkulacji proporcji VAT tylko w sytuacjach, gdy benefity są nieodpłatne, a jednocześnie nieopodatkowane ani zwolnione od VAT (interpretacja indywidualna Dyrektora KIS z 1.2.2022 r., 0111-KDIB3-2.4012.993.2021.1.AZ).
